Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PrcdQ00LT2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms