Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms