Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pax8Q00288 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms