Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx2Q00262 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms