Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

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Length 3,329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Brca2P97929 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Brca2P97929 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Brca2P97929 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brca2P97929 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Brca2P97929 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Brca2P97929 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Brca2P97929 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Brca2P97929 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Brca2P97929 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brca2P97929 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Brca2P97929 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Brca2P97929 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Brca2P97929 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Brca2P97929 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Brca2P97929 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Brca2P97929 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brca2P97929 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Brca2P97929 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Brca2P97929 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brca2P97929 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Brca2P97929 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brca2P97929 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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