Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry1P97784 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry1P97784 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry1P97784 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry1P97784 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry1P97784 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry1P97784 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry1P97784 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cry1P97784 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms