Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabpb2P81069 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabpb2P81069 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms