Protein–RNA interactions for Protein: P80316

Cct5, T-complex protein 1 subunit epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct5P80316 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cct5P80316 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cct5P80316 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cct5P80316 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cct5P80316 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cct5P80316 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cct5P80316 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms