Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkn1P70268 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkn1P70268 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms