Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Acta1P68134 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Acta1P68134 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Acta1P68134 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Acta1P68134 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Acta1P68134 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms