Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps3P62908 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3P62908 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3P62908 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3P62908 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3P62908 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps3P62908 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps3P62908 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps3P62908 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps3P62908 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms