Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rab3cP62823 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab3cP62823 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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