Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd3P62320 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms