Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SnrpfP62307 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms