Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Itga11P61622 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga11P61622 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga11P61622 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga11P61622 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga11P61622 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga11P61622 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga11P61622 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga11P61622 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms