Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 2,134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd6P61407 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd6P61407 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms