Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abce1P61222 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abce1P61222 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abce1P61222 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abce1P61222 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abce1P61222 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abce1P61222 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abce1P61222 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abce1P61222 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abce1P61222 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms