Protein–RNA interactions for Protein: P60334

Cdo1, Cysteine dioxygenase type 1, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdo1P60334 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdo1P60334 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms