Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hps5P59438 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hps5P59438 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hps5P59438 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hps5P59438 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hps5P59438 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hps5P59438 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps5P59438 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps5P59438 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hps5P59438 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms