Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf2P59222 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms