Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P58686 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P58686 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P58686 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P58686 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P58686 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P58686 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P58686 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P58686 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P58686 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P58686 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P58686 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P58686 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P58686 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P58686 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P58686 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P58686 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P58686 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P58686 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P58686 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P58686 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P58686 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P58686 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P58686 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P58686 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P58686 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P58686 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P58686 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P58686 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P58686 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P58686 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P58686 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P58686 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P58686 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P58686 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P58686 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P58686 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P58686 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P58686 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P58686 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P58686 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P58686 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P58686 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P58686 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P58686 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P58686 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P58686 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P58686 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P58686 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P58686 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P58686 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P58686 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P58686 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P58686 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P58686 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P58686 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P58686 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P58686 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P58686 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P58686 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P58686 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P58686 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P58686 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P58686 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P58686 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P58686 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P58686 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P58686 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P58686 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P58686 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P58686 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P58686 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P58686 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P58686 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P58686 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P58686 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P58686 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P58686 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P58686 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P58686 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P58686 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P58686 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P58686 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P58686 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P58686 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P58686 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P58686 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P58686 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P58686 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P58686 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P58686 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P58686 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P58686 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P58686 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P58686 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P58686 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P58686 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P58686 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P58686 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P58686 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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