Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rrp1P56183 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp1P56183 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms