Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cux1P53564 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cux1P53564 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cux1P53564 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cux1P53564 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cux1P53564 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cux1P53564 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cux1P53564 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux1P53564 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cux1P53564 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cux1P53564 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cux1P53564 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cux1P53564 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cux1P53564 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms