Protein–RNA interactions for Protein: P52479

Usp10, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp10P52479 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp10P52479 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp10P52479 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp10P52479 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp10P52479 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp10P52479 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp10P52479 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp10P52479 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp10P52479 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp10P52479 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp10P52479 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Usp10P52479 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Usp10P52479 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp10P52479 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Usp10P52479 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp10P52479 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Usp10P52479 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Usp10P52479 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Usp10P52479 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Usp10P52479 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp10P52479 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp10P52479 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp10P52479 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp10P52479 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms