Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClgnP52194 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClgnP52194 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ClgnP52194 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ClgnP52194 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms