Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apobec1P51908 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms