Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr5P51682 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms