Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnt2P50752 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnt2P50752 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms