Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa-rs12P50716 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa-rs12P50716 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms