Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HpdP49429 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
HpdP49429 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HpdP49429 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HpdP49429 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HpdP49429 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HpdP49429 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HpdP49429 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HpdP49429 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpdP49429 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpdP49429 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpdP49429 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpdP49429 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpdP49429 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpdP49429 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpdP49429 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpdP49429 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpdP49429 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpdP49429 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpdP49429 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HpdP49429 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpdP49429 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpdP49429 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpdP49429 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpdP49429 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpdP49429 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpdP49429 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpdP49429 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpdP49429 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpdP49429 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpdP49429 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpdP49429 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpdP49429 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpdP49429 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpdP49429 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpdP49429 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpdP49429 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpdP49429 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpdP49429 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpdP49429 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpdP49429 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpdP49429 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpdP49429 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpdP49429 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpdP49429 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HpdP49429 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpdP49429 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpdP49429 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HpdP49429 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpdP49429 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpdP49429 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpdP49429 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpdP49429 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpdP49429 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpdP49429 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpdP49429 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpdP49429 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpdP49429 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpdP49429 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpdP49429 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpdP49429 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpdP49429 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HpdP49429 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpdP49429 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpdP49429 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpdP49429 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpdP49429 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HpdP49429 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpdP49429 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HpdP49429 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpdP49429 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpdP49429 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpdP49429 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HpdP49429 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpdP49429 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HpdP49429 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpdP49429 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpdP49429 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpdP49429 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpdP49429 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpdP49429 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpdP49429 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpdP49429 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpdP49429 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpdP49429 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpdP49429 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpdP49429 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpdP49429 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpdP49429 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpdP49429 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpdP49429 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpdP49429 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpdP49429 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HpdP49429 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpdP49429 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpdP49429 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpdP49429 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpdP49429 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpdP49429 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpdP49429 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms