Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CitP49025 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CitP49025 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CitP49025 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CitP49025 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CitP49025 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CitP49025 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CitP49025 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CitP49025 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CitP49025 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CitP49025 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CitP49025 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CitP49025 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CitP49025 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CitP49025 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CitP49025 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CitP49025 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CitP49025 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CitP49025 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CitP49025 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CitP49025 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CitP49025 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CitP49025 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CitP49025 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CitP49025 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CitP49025 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CitP49025 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CitP49025 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CitP49025 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CitP49025 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CitP49025 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CitP49025 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CitP49025 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CitP49025 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CitP49025 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CitP49025 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CitP49025 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CitP49025 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CitP49025 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CitP49025 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CitP49025 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CitP49025 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CitP49025 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CitP49025 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CitP49025 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CitP49025 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CitP49025 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CitP49025 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CitP49025 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CitP49025 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CitP49025 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CitP49025 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CitP49025 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CitP49025 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CitP49025 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CitP49025 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CitP49025 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CitP49025 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CitP49025 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CitP49025 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CitP49025 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CitP49025 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CitP49025 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CitP49025 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CitP49025 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CitP49025 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CitP49025 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CitP49025 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CitP49025 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CitP49025 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CitP49025 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CitP49025 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CitP49025 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CitP49025 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CitP49025 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CitP49025 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CitP49025 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CitP49025 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CitP49025 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CitP49025 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CitP49025 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CitP49025 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CitP49025 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CitP49025 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CitP49025 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CitP49025 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CitP49025 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CitP49025 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CitP49025 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CitP49025 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CitP49025 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CitP49025 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CitP49025 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CitP49025 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CitP49025 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CitP49025 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CitP49025 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CitP49025 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CitP49025 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CitP49025 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms