Protein–RNA interactions for Protein: P48725

Pcnt, Pericentrin, mousemouse

Predictions only

Length 2,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcntP48725 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcntP48725 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcntP48725 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcntP48725 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcntP48725 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PcntP48725 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcntP48725 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcntP48725 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcntP48725 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcntP48725 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcntP48725 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcntP48725 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcntP48725 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcntP48725 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PcntP48725 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcntP48725 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcntP48725 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcntP48725 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcntP48725 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcntP48725 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcntP48725 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcntP48725 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcntP48725 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PcntP48725 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcntP48725 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcntP48725 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PcntP48725 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PcntP48725 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcntP48725 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcntP48725 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcntP48725 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcntP48725 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PcntP48725 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcntP48725 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcntP48725 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcntP48725 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcntP48725 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcntP48725 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcntP48725 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcntP48725 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcntP48725 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcntP48725 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PcntP48725 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcntP48725 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PcntP48725 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PcntP48725 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PcntP48725 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PcntP48725 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PcntP48725 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PcntP48725 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PcntP48725 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PcntP48725 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PcntP48725 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PcntP48725 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PcntP48725 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PcntP48725 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcntP48725 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcntP48725 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcntP48725 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcntP48725 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcntP48725 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcntP48725 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcntP48725 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcntP48725 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcntP48725 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcntP48725 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcntP48725 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcntP48725 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcntP48725 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PcntP48725 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PcntP48725 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcntP48725 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcntP48725 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcntP48725 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcntP48725 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcntP48725 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcntP48725 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcntP48725 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcntP48725 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcntP48725 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcntP48725 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcntP48725 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PcntP48725 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcntP48725 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcntP48725 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcntP48725 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcntP48725 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PcntP48725 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcntP48725 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcntP48725 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcntP48725 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcntP48725 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcntP48725 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcntP48725 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcntP48725 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcntP48725 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PcntP48725 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcntP48725 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcntP48725 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcntP48725 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms