Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LmnaP48678 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LmnaP48678 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LmnaP48678 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LmnaP48678 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LmnaP48678 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LmnaP48678 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LmnaP48678 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LmnaP48678 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms