Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tlx1P43345 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tlx1P43345 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tlx1P43345 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms