Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msh2P43247 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msh2P43247 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msh2P43247 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msh2P43247 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msh2P43247 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Msh2P43247 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh2P43247 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh2P43247 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms