Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tnfsf9P41274 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Tnfsf9P41274 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Tnfsf9P41274 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Tnfsf9P41274 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfsf9P41274 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tnfsf9P41274 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tnfsf9P41274 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tnfsf9P41274 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tnfsf9P41274 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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