Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TfamP40630 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TfamP40630 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TfamP40630 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TfamP40630 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TfamP40630 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TfamP40630 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TfamP40630 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TfamP40630 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TfamP40630 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TfamP40630 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TfamP40630 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TfamP40630 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TfamP40630 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TfamP40630 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TfamP40630 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TfamP40630 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TfamP40630 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TfamP40630 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TfamP40630 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TfamP40630 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TfamP40630 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TfamP40630 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TfamP40630 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TfamP40630 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TfamP40630 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TfamP40630 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TfamP40630 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TfamP40630 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TfamP40630 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TfamP40630 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TfamP40630 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TfamP40630 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TfamP40630 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TfamP40630 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TfamP40630 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TfamP40630 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TfamP40630 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TfamP40630 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TfamP40630 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TfamP40630 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TfamP40630 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TfamP40630 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TfamP40630 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TfamP40630 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TfamP40630 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TfamP40630 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TfamP40630 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TfamP40630 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TfamP40630 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TfamP40630 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TfamP40630 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TfamP40630 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TfamP40630 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TfamP40630 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TfamP40630 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TfamP40630 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TfamP40630 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TfamP40630 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TfamP40630 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TfamP40630 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TfamP40630 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TfamP40630 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TfamP40630 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TfamP40630 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TfamP40630 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TfamP40630 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TfamP40630 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TfamP40630 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TfamP40630 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TfamP40630 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TfamP40630 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TfamP40630 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TfamP40630 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TfamP40630 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TfamP40630 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TfamP40630 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TfamP40630 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TfamP40630 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TfamP40630 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TfamP40630 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TfamP40630 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TfamP40630 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TfamP40630 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TfamP40630 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TfamP40630 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TfamP40630 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TfamP40630 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TfamP40630 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TfamP40630 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TfamP40630 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TfamP40630 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TfamP40630 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TfamP40630 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TfamP40630 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TfamP40630 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TfamP40630 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TfamP40630 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TfamP40630 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TfamP40630 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms