Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd1P40201 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd1P40201 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd1P40201 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd1P40201 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chd1P40201 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Chd1P40201 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd1P40201 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chd1P40201 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms