Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf2P39429 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf2P39429 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf2P39429 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf2P39429 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf2P39429 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf2P39429 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf2P39429 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf2P39429 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf2P39429 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf2P39429 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf2P39429 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms