Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddit3P35639 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 641.5 ms