Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab20P35295 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab20P35295 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rab20P35295 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab20P35295 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab20P35295 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab20P35295 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab20P35295 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab20P35295 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab20P35295 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms