Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pola2P33611 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pola2P33611 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pola2P33611 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pola2P33611 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pola2P33611 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pola2P33611 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pola2P33611 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pola2P33611 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pola2P33611 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms