Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Hoxc5P32043 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms