Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa3P28310 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa3P28310 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa3P28310 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa3P28310 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa3P28310 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms