Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpl3P27659 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl3P27659 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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