Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk11bP24788 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk11bP24788 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms