Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RarbP22605 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RarbP22605 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RarbP22605 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RarbP22605 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RarbP22605 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RarbP22605 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RarbP22605 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RarbP22605 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RarbP22605 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RarbP22605 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RarbP22605 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RarbP22605 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RarbP22605 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RarbP22605 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RarbP22605 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RarbP22605 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RarbP22605 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RarbP22605 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RarbP22605 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RarbP22605 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RarbP22605 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RarbP22605 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RarbP22605 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RarbP22605 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RarbP22605 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RarbP22605 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RarbP22605 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RarbP22605 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RarbP22605 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RarbP22605 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RarbP22605 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RarbP22605 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RarbP22605 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RarbP22605 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RarbP22605 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RarbP22605 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RarbP22605 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RarbP22605 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RarbP22605 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RarbP22605 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RarbP22605 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RarbP22605 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RarbP22605 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RarbP22605 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RarbP22605 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RarbP22605 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RarbP22605 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RarbP22605 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RarbP22605 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RarbP22605 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RarbP22605 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RarbP22605 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RarbP22605 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RarbP22605 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RarbP22605 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RarbP22605 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RarbP22605 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RarbP22605 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RarbP22605 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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