Protein–RNA interactions for Protein: P22272

Il6ra, Interleukin-6 receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6raP22272 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Il6raP22272 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Il6raP22272 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Il6raP22272 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Il6raP22272 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Il6raP22272 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Il6raP22272 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms