Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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BdnfP21237 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BdnfP21237 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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BdnfP21237 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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BdnfP21237 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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BdnfP21237 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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BdnfP21237 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BdnfP21237 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BdnfP21237 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BdnfP21237 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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