Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb9P20615 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxb9P20615 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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